生物安全櫃中安全處理樣本的實驗操作過程中需要註意以下幾點：
首先，實驗室人員必須穿戴以下防護設備：口罩、眼罩、面罩、手套、鞋套、隔離服或防護服、呼吸器等，在離開實驗室前應將其取下，為避免防護設備造成的環境污染。
其次，因為實驗室生物污染的重要來源是產生氣溶膠，實驗室可以通過使用含有熒光素的假樣本來檢測氣溶膠的產生路徑以評估其傳播水平。
再者，在使用註射器和皮下註射針頭的時候，只能從隔膜塞住的試管中取出液體進行接種。嚴禁將皮下註射針頭從註射器中取出或重新蓋上蓋子，以免造成意外的自我接種。
接著，實驗室工作人員需要輕輕按壓移液器應，並利用吸頭抵住離心管或試管內壁，緩慢進行移液操作，進行樣本處理。如若出現樣本外溢，都需要馬上使用消毒劑進行徹底清潔。
最後，實驗結束後，所有工作台區域，實驗室設備，如：移液器、試管架都必須進行嚴格的消毒，以確保實驗及實驗室安全。
